Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Soga3Q6NZL0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Soga3Q6NZL0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Soga3Q6NZL0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms