Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZK8

Ptpdc1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpdc1Q6NZK8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ptpdc1Q6NZK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpdc1Q6NZK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms