Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF0

Ocrl, Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OcrlQ6NVF0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
OcrlQ6NVF0 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
OcrlQ6NVF0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
OcrlQ6NVF0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OcrlQ6NVF0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OcrlQ6NVF0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OcrlQ6NVF0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
OcrlQ6NVF0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms