Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B4galnt3Q6L8S8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B4galnt3Q6L8S8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
B4galnt3Q6L8S8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms