Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
NipblQ6KCD5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
NipblQ6KCD5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms