Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Krt39Q6IFX4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt39Q6IFX4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt39Q6IFX4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms