Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Scaf8Q6DID3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Scaf8Q6DID3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Scaf8Q6DID3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Scaf8Q6DID3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms