Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3c1Q6DFV6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms