Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pram1Q6BCL1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pram1Q6BCL1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Pram1Q6BCL1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms