Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PnkdQ69ZP3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
PnkdQ69ZP3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnkdQ69ZP3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnkdQ69ZP3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnkdQ69ZP3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PnkdQ69ZP3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms