Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Lrrcc1Q69ZB0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrcc1Q69ZB0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrcc1Q69ZB0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms