Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cdk13Q69ZA1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cdk13Q69ZA1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms