Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ino80dQ66JY2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ino80dQ66JY2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ino80dQ66JY2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms