Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprcapQ64697 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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PtprcapQ64697 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtprcapQ64697 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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PtprcapQ64697 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
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PtprcapQ64697 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
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PtprcapQ64697 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PtprcapQ64697 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PtprcapQ64697 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms