Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim24Q64127 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trim24Q64127 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Trim24Q64127 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
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