Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pan3Q640Q5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pan3Q640Q5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms