Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vamp1Q62442 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vamp1Q62442 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Vamp1Q62442 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms