Protein–RNA interactions for Protein: Q62413

Epha6, Ephrin type-A receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha6Q62413 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha6Q62413 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha6Q62413 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms