Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Kdm5dQ62240 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC38.32■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Kdm5dQ62240 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
Kdm5dQ62240 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
Kdm5dQ62240 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms