Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sycp1Q62209 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sycp1Q62209 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms