Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rbm38Q62176 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Rbm38Q62176 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rbm38Q62176 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Rbm38Q62176 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rbm38Q62176 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Rbm38Q62176 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rbm38Q62176 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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