Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm45166-201ENSMUST00000209073 683 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Prm3Q62100 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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Prm3Q62100 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Prm3Q62100 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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Prm3Q62100 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Prm3Q62100 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms