Protein–RNA interactions for Protein: Q61716

Ifna11, Interferon alpha-11, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna11Q61716 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ifna11Q61716 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ifna11Q61716 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms