Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gli3Q61602 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gli3Q61602 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gli3Q61602 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Gli3Q61602 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms