Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Tfap2bQ61313 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tfap2bQ61313 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tfap2bQ61313 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms