Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ctnna2Q61301 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ctnna2Q61301 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms