Protein–RNA interactions for Protein: Q61187

Tsg101, Tumor susceptibility gene 101 protein, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsg101Q61187 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tsg101Q61187 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tsg101Q61187 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tsg101Q61187 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms