Protein–RNA interactions for Protein: Q61143

Trpc6, Short transient receptor potential channel 6, mousemouse

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Length 930 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc6Q61143 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trpc6Q61143 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trpc6Q61143 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trpc6Q61143 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms