Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
JrkQ60976 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
JrkQ60976 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
JrkQ60976 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
JrkQ60976 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
JrkQ60976 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms