Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vdac1Q60932 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vdac1Q60932 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms