Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DbpQ60925 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DbpQ60925 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
DbpQ60925 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms