Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Atf3Q60765 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Atf3Q60765 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Atf3Q60765 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms