Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Rnf123Q5XPI3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rnf123Q5XPI3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rnf123Q5XPI3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms