Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Utp20Q5XG71 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Utp20Q5XG71 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Utp20Q5XG71 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms