Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Med13Q5SWW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Med13Q5SWW4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Med13Q5SWW4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms