Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mks1Q5SW45 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Mks1Q5SW45 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Mks1Q5SW45 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms