Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ankrd40Q5SUE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ankrd40Q5SUE8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ankrd40Q5SUE8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 733.2 ms