Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Utp18Q5SSI6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Utp18Q5SSI6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Utp18Q5SSI6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms