Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam46cQ5SSF7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam46cQ5SSF7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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