Protein–RNA interactions for Protein: Q5SFM8

Rbm27, RNA-binding protein 27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm27Q5SFM8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rbm27Q5SFM8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rbm27Q5SFM8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rbm27Q5SFM8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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