Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cacna2d4Q5RJF7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cacna2d4Q5RJF7 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms