Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rtp3Q5QGU6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtp3Q5QGU6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms