Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
1810065E05RikQ5NC41 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
1810065E05RikQ5NC41 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
1810065E05RikQ5NC41 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms