Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ecm2Q5FW85 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ecm2Q5FW85 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ecm2Q5FW85 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms