Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nlrc3Q5DU56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Nlrc3Q5DU56 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nlrc3Q5DU56 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms