Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT8

Pnma5, Paraneoplastic antigen-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma5Q5DTT8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Pnma5Q5DTT8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pnma5Q5DTT8 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms