Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Eme2Q56A04 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Eme2Q56A04 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Eme2Q56A04 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms