Protein–RNA interactions for Protein: Q52KI8

Srrm1, Serine/arginine repetitive matrix protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srrm1Q52KI8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srrm1Q52KI8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srrm1Q52KI8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Srrm1Q52KI8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms