Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc3lQ4KL14 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trappc3lQ4KL14 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trappc3lQ4KL14 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms