Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Foxn3Q499D0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxn3Q499D0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxn3Q499D0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms